Camille Charbonnier

Inférence de réseaux de régulation génétique à partir de données du transcriptome non indépendamment et indentiquement distribuées (2009-2012)

Camille’s PhD was co-supervised with Christophe Ambroise (50%/50%), from 2009 to 2012.

PhD manucript

  1. PhD thesis
    Inférence de réseaux de régulation génétique à partir de données du transcriptome non indépendamment et indentiquement distribuées
    Charbonnier, C. (2012). Inférence de réseaux de régulation génétique à partir de données du transcriptome non indépendamment et indentiquement distribuées. Université d’Évry-Val-d’Essonne.
    Université d’Évry-Val-d’Essonne, 2012
    Website

Journal papers

    1. Ann Appl Stat
      Sparsity in sign-coherent groups of variables via the cooperative-Lasso
      Julien Chiquet, Y. Grandvalet, and C. Charbonnier
      The Annals of Applied Statistics, 2012
      arXiv DOI Bib
    2. SAGMB
      Weighted-Lasso for structured network inference from time course data
      C. Charbonnier, Julien Chiquet, and C. Ambroise
      Statistical Applications in Genomics and Molecular Biology, 2010
      arXiv DOI Bib Code
    1. Probabilistic graphical models dedicated to applications in genetics, genomics and postgenomics
      M. Jeanmoungin, C. Charbonnier, M. Guedj, and J. Chiquet
      2014

    Conferences

    1. Sparsity with sign-coherent groups of variables via the cooperative-Lasso
      J. Chiquet, Y. Grandvalet, and C. Charbonnier
      In Proceedings of SPARS’11, Edinburgh, 2011
    2. Gene expression signature in whole blood after treatment with amino acid copolymer PI-2301 in multiple sclerosis
      JC Corvol, C Vrignaud, K Tahiri, F. Cormier, C. Charbonnier, F. Charbonnier-Beaupel, W. Carpentier, A. Patat, E. Mascioli, Y. Chiquet, C. Ambroise, G. Edan, and E. Zanelli
      In European Committee for Treatment and Research in Multiple Sclerosis, 2010
    1. Weighted-Lasso for Structured Network Inference for Time-Course data
      C. Charbonnier, J. Chiquet, and C. Ambroise
      In JOBIM’10, Montpellier, 2010
    2. SIMoNe : Statistical Inference for Modular Networks
      J. Chiquet, C. Charbonnier, and C. Ambroise
      In Workshop MODGRAPH, JOBIM’09, Nantes, 2009